Pernille Seljom har siden 2008 vært en del av en forskergruppe innenfor fornybare energisystemer ved IFE som jobber med analyser av framtidens energisystem, blant annet ved bruk av TIMES-modeller. Hun tok en doktorgrad innen dette ved NTNU i 2017. For tiden forsker Seljom på verdien av energifleksibilitet i et systemperspektiv, inkludert konkurransen og samspillet mellom forskjellige kilder til fleksibilitet. Hun er også IFEs representant i det nye forskningsprosjektet FLEXBUILD, som skal samkjøre en modell av byggsektoren med overordnede kraft- og energisystemmodeller for å analysere rollen av fleksible bygg i fremtidens energisystem.